沈轩和团队带着边境小镇救治的成果与感悟回到江城，还未来得及好好休整，便全身心投入到罕见病治疗经验的梳理与研究中。一天，沈轩如往常一样在中医研究院的古籍馆中查阅资料，试图从浩如烟海的古书中找到更多关于类似病症的记载，为后续研究提供思路。
古籍馆内弥漫着陈旧纸张特有的气息，阳光透过斑驳的窗户洒在一排排书架上。沈轩在一个偏僻的角落，发现了一本从未见过的古籍，封面古朴，刻着《灵枢医典遗篇》几个大字。他好奇地翻开，刚一打开，一股神秘的气息扑面而来，古籍内的文字竟似有生命一般，闪烁着微光。沈轩心中一惊，仔细研读起来，发现其中记载了诸多失传的中医针法与方剂，更有一段关于上古医道传承的隐秘记载。
书中提到，在远古时期，有一位神医掌握着超凡的医术，能沟通天地灵气，治愈百病。他将毕生所学封印在一处神秘之地，等待有缘人开启，以传承医道，普救世人。沈轩正看得入神，突然古籍光芒大盛，一道光束直射入他的眉心。刹那间，沈轩只觉脑海中涌入大量信息，关于上古针法的精妙运用、方剂的神奇配伍，以及一些从未听闻的医理知识。他呆立原地，许久才缓过神来，心中明白，自己竟意外获得了这上古医道的传承。
与此同时，江城突发一场诡异的疫病。患者们高热不退，皮肤出现奇异的纹路，精神萎靡，口中喃喃呓语，似被什么邪祟附身。普通的药物对此疫病毫无作用，患者数量迅速增加，医院人满为患，整个城市陷入恐慌。沈轩得知消息后，立刻放下手中的研究，带着团队奔赴抗疫一线。
在医院里，沈轩看到一位年轻患者，面色潮红，眼神迷离，正痛苦地挣扎着。患者的母亲在一旁哭泣：“医生，救救我儿子，他昨天还好好的，今天就变成这样了。”沈轩走上前，运用新获得的上古医道知识，仔细观察患者的症状。他发现患者的脉象紊乱，体内似有一股神秘的力量在肆虐，破坏着气血运行。沈轩心中一动，想起古籍中记载的一种针法——“灵犀镇邪针”，或许能克制这股邪气。
沈轩取出银针，在手中轻轻转动，银针竟微微颤动，似与周围的天地灵气产生了共鸣。他迅速找准患者身上的穴位，施针而下。随着银针的刺入，患者的挣扎渐渐停止，脸上的痛苦之色也有所缓解。一旁的团队成员们惊讶地看着这一幕，他们从未见过如此神奇的针法。一位年轻的医生忍不住问道：“沈老师，这是什么针法？怎么如此神奇？”沈轩一边施针，一边解释道：“这是上古流传下来的针法，通过刺激穴位，调动人体自身的正气，以抵御邪气入侵。这疫病来势汹汹，普通针法难以奏效，唯有此针法或许能破局。”
然而，并非所有患者都能通过一次施针就好转。一位重症患者在施针后，病情虽有短暂缓解，但很快又再次恶化。沈轩皱起眉头，陷入沉思。他再次查阅脑海中的上古医道知识，发现对于这类重症患者，还需配合一味特殊的方剂——“清灵祛疫汤”。这方剂的药材极为罕见，其中一味“灵犀草”，据说生长在人迹罕至的深山之中，极为难寻。
沈轩决定亲自去寻找灵犀草。江婉清得知后，坚决要一同前往：“沈先生，这一路危险未知，我不放心你一个人去。而且我也想为救治患者出份力。”沈轩拗不过她，只好答应。两人在当地向导的带领下，踏入了深山。山林中荆棘丛生，道路崎岖，时不时还传来野兽的吼声。江婉清虽有些害怕，但看着沈轩坚定的背影，心中涌起一股勇气。
经过几天的艰难跋涉，他们终于在一处山谷中发现了灵犀草。灵犀草散发着淡淡的蓝光，周围弥漫着一股清新的气息。沈轩小心翼翼地采摘下灵犀草，兴奋地对江婉清说：“婉清，找到了！有了这灵犀草，患者们就有救了。”江婉清看着沈轩脸上的疲惫与喜悦，心中满是感动。
回到医院后，沈轩立刻按照古籍中的记载，熬制“清灵祛疫汤”。他亲自守在药炉前，严格控制火候和时间。药汤熬好后，他为重症患者们一一喂下。在药物和针法的双重作用下，患者们的病情逐渐好转，高热退去，皮肤纹路也慢慢消失。
然而，这场疫病似乎并未那么简单。就在大家以为疫情即将结束时，又出现了新的情况。一些康复的患者突然再次发病，而且症状更加严重，体内的邪气变得更为强大。沈轩意识到，这疫病背后似乎隐藏着某种未知的力量，在操控着一切。
为了彻底弄清楚疫病的根源，沈轩决定深入研究患者体内的邪气。他运用上古医道中的“灵视之术”，集中精神，观察患者体内的气息流动。在一次观察中，他发现患者体内的邪气竟与城市地下的某种能量波动产生了共鸣。沈轩推测，可能是城市地下存在着某种古老的封印，因某些原因被破坏，导致邪气外泄，引发了这场疫病。
沈轩将自己的发现告知团队成员和相关部门。大家经过商议，决定寻找解除封印、彻底消除邪气的方法。在古籍的指引下，他们得知需要找到三颗上古灵石，分别代表着金、木、水三种元素，利用灵石的力量重新封印邪气。
寻找灵石的过程充满艰辛。第一颗灵石据说在一座废弃的矿山中，那里地形复杂，还有许多危险的陷阱。沈轩带领团队成员深入矿山，在黑暗中摸索前行。突然，一阵剧烈的震动传来，前方的道路塌陷，出现了一个巨大的裂缝。一位年轻的成员吓得脸色苍白：“沈老师，这可怎么办？”沈轩镇定地说：“大家别慌，我们仔细找找，一定有其他路可以绕过去。”经过一番寻找，他们终于找到一条狭窄的通道，艰难地通过了塌陷区域。
在矿山深处，他们终于找到了第一颗灵石。灵石散发着金色的光芒，蕴含着强大的力量。沈轩小心翼翼地将灵石收好，继续踏上寻找第二颗灵石的征程。
第二颗灵石在一片神秘的森林中，森林中迷雾弥漫，充满了各种未知的危险。团队成员们在森林中迷失了方向，食物也所剩不多。江婉清有些担忧地说：“沈先生，这样下去不是办法，我们得想个办法走出这片迷雾。”沈轩闭上眼睛，运用上古医道中的“灵觉之法”，感知周围的气息流动。片刻后，他睁开眼睛，指着一个方向说：“跟我来，这边应该能找到出去的路。”在沈轩的带领下，大家终于走出了迷雾，找到了第二颗灵石。
第三颗灵石位于一座冰封的雪山之巅。雪山上寒风凛冽，积雪深厚，攀爬十分困难。一位成员在攀爬过程中不慎滑落，沈轩眼疾手快，迅速抛出一根绳索，将他拉了上来：“大家小心，这雪山路滑，一定要注意安全。”经过艰难的攀爬，他们终于登上了雪山之巅，找到了第三颗灵石。
集齐三颗灵石后，沈轩按照古籍中的方法，在城市中心的一处古老祭坛上，运用灵石的力量重新封印了邪气。随着封印的完成，城市中的疫病迅速消退，患者们彻底康复。
江城恢复了往日的平静，人们对沈轩和他的团队充满了感激。沈轩知道，这只是他医道征程中的一次历练，未来还会有更多的挑战等待着他。而他获得的上古医道传承，将成为他守护世人健康的强大助力。他与江婉清的感情，也在这次历经生死的冒险中，变得更加坚不可摧。在未来的日子里，沈轩将继续凭借着对中医的热爱和执着，以及上古医道的智慧，在医道之路上砥砺前行，为更多的患者带去希望的曙光。