而在森林中调查在这场风暴中宝可梦的情况的大木博士和小建，发现整座小岛上的宝可梦，生命力和体力都在缓慢的消逝中，而流向就是高空之中、风暴中心的洛奇亚。
一片枯叶落在小建的头上，小建猛然地叫道：“大木博士，就连这些大树也在受这股风暴影响了。”
大木博士不由的抬头，一片，两片，三片，十片······越来越多的枯叶，落了下来。大木博士一边在纸上记录着什么，一边说到：“看来，洛奇亚是在汲取整座小岛上的生命的生命能量，但只是恢复自身所消耗的能量，根本用不了这么多啊。”
“那既然宝可梦和植物都被吸取了生命能量，”大木博士低头看着自己的手掌，喃喃道：“那人类呢？”
刚一说完，大木博士不由地一阵头晕。
小智、斯科特还有叶音三人，回到了村子，小智找到了芙卢拉，并要求她再次在法阵上吹奏笛子。
“这么做，是为了什么？”
小智没有解释，只管让她吹就是了。
本来芙卢拉和姐姐小优，还在安抚聚集在一起的村民，这下子被再次赋予巫女的职责，她只好再次穿回巫女服。她穿着巫女服，内心忐忑不定地走向村子的祭坛法阵。
悠扬的笛声再次被吹起，远处三座圣殿也散发着微弱的光芒。而云层之上，高空之中的洛奇亚，也破开黑云，落到了人们的视线当中。凝视着那满身漆黑的羽毛，和宛如血月的双瞳，众人无不被这巨大的压迫感，压得喘不过气。
“等洛奇亚恢复了，下一个目标，就是一个又一个的人类大陆了喵。到时候，人类将被放逐，属于宝可梦的崭新纪元即将开启了喵！”喵喵用颤抖却威严十足的声音说着。
飞在空中的小绿，一眼便看见了远处菩提科特村的上空二十多米高的位置，悬浮着黑暗洛奇亚。“糟了，洛奇亚要开始了吗？”
同样察觉到这一点的娜姿，心急如焚，当场就要施展瞬间移动，前往村子，但小霞还有科拿都要求带上自己。娜姿冷冷地说，自己最多只能带一个人。
就在两人顾忌对方，没有开口之际，小绿站了出来：“带我回去！”
“欸？”
“欸？”
小霞和科拿二脸懵逼，怎么还能轮得到你个男人出来插一脚。但没等两人反对，娜姿就点了点头，抓住小绿的手臂，传送离开了这里。
“······”科拿一阵无语。
小霞立即拨通通讯器，问小智，他们那边到底怎么回事，用不用自己这些个馆主赶回去帮忙。结果小智只说：“不用了，你们待在那，呼吁大家将自己的宝可梦，放出来就行了。”